Schimmel zou geen probleem voor bomen moeten zijn. Sterker nog; schimmels zijn heel waardevol voor je bomen. Mycorrhiza is een samenlevingsvorm van schimmels en planten via de wortels. Bijna alle planten werken ondergronds samen met schimmels. Nu zitten deze schimmels echter in het substraat en leeft het er niet bovenop.
Het staat natuurlijk minder aantrekkelijk. Wat je zou kunnen doen is, om met een bonsai vakterm te gooien, soji uitvoeren. Dit is de bovenlaag van het substraat verwijderen en frisse toevoegen.
Over het weinig aantal nieuwe scheuten kan ik je niet zoveel zeggen. Ik heb weinig verstand van Ficus.